社会的快速发展带来了越来越多的环境污染物，如：工业废弃物、残留农药、城市生活垃圾等几乎遍布于人类的生活环境中，并且对人类健康和生态坏境也带来日益严重的危害。而这些污染物绝大部分会由于雨水冲刷，肆意排放等进入到人类赖以生存的水环境中。
一系列水污染事故的发生,使水环境监测越来越受重视:并且对分析的灵敏度、准确度、分辨率和分析精度都提出了很高要求。高效液相色谱技术作为一种十分有效的分离分析手段,在水环境监测领域发挥了重要的作用，其在水环境监测中的应用主要分为三个方面:
一、对传统监测项目指标的监测
对传统污染物的监测主要是针对日常水体中常见的污染物进行重点监测，从而进行把握与评价。同时，传统污染物的监测还包括了对特定企业排污点的污水监测，作为其环保达标的重要依据。
二、对水体中的有机物进行监测
在传统污染物的基础之上，工业以及农业淋容等多方面因素会对水体造成一定的有机物污染,在针对有机物的污染监测过程中，传统的监测方法无法在精度与效率方面达到要求。在此方面应用高效液相色谱仪在对有机物进行定型的同时进行定量的监测。主要监测的项目包括工业有机污染物(氰化物、挥发酚、石油类、总有机物等)、农业有机物(如杀虫剂除草剂、消化抑制剂)、特殊有机物(微生物代谢物、医疗污染物、生活污水等)。针对如上的有机物监测一方面能够对水体中有机污染现状进行评价。另一方面可以鉴别污染物种类，进而对排查污染源提供一定的帮助。
三、对不同价态及其形态的污染物的监测
同种化学元素的不同存在价态以及形态对其生物毒性的影响至关重要。比如铬元素在水体中存在三价与六价之分其中三价铬毒性较小且在较大浓度范围内对人体有益，而六价铬则表现为较强的生物毒性，在较低浓度下对人体会造成较大危害。在水环境的监测过程中传统的六价铬的监测方法是利用六价铬与二苯碳酰二肼的显色反映进行检测的，这种检测方式由于收到氧化还原条件的影响容易造成较大误差进而使得对水体环境的判断失准。采用高效液相色谱仪能够同时监测同种元素的不同价态进而对水体的污染物及其毒性进行更好的定量分析,为后续的环境评价与治理奠定基础。
高效液相色谱具有分析速度快、分离效率高、检测灵敏度高、检测自动化、适用范围广、组分易回收、样品处理较简单等优点。在环境分析中多用于监测水中有毒物质的痕量分析,测定空气中污染物的含量,以及土壤中有机农药的分析,对人们生活环境的安全性起到了不可忽视的作用。
