在离子色谱仪对于饮用水所含离子检测的实验过程中，为了防止形成气泡，淋洗液需要经过在线脱气装置对其进行脱气，对待测水体配置出一系列的标准物质的工作液，并控制相应的工作液的浓度。具体的操作：
首先使用离子水注射器并将针头清洗干净，将盛放离子水的瓶对水样进样口进行多次的清洗，而后离子进样吸入到离子色谱仪中，使用注射器依次吸取2ml左右的待测离子水-淋洗液-样品注入定量环境清洗液等重复3次，而后再次注入样品，将离子色谱仪的状态转入“分析”状态，状态转移过程要迅速，离子色谱仪将自动对吸入到离子色谱仪中的待测水样进行分析，并采集谱图。
待到待测水样的出峰完毕后，停止离子色谱仪，将分析数据保存，并保存谱图，尽量采用峰面积来对阴离子进行定量，其中可以采用单点法或是曲线法来对峰面积进行计算。在使用SHODEX柱完成对于阴离子数值的分析后，继续通淋洗液并持续5分钟以上后停止运作，而后关闭离子色谱仪。
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