流动注射分析仪但与4-氨基安替比林萃取分光光度法比较，虽然仍存在以下几个问题：

• 硬件成本较高，且流动注射分析仪仪器设备需要定期维护和保养，需要定期清洗仪器管路、检查泵管。
• 流动注射分析仪虽灵敏，还应注意样品，如采集样品浑浊，检测前需离心或用0.45 μm滤膜过滤，以免堵塞传输管线或影响检测结果。

但是，近年来，随着社会发展，为了适应新形式下的检测需求，流动注射分析仪具有高灵敏度、高选择性的优点，不仅检测效率高，还能与原子吸收、原子荧光等仪器联用，使该方法具有更加灵活的选择性和应用性，逐渐成为水质检测的常规方法。
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